在引入MES系统的过程中，实施是一个极其关键却经常被忽视的环节。将MES系统导入到企业的运作体系之中，企业需要先完善管理基础，根据自身情况选择好“合身”的MES软件系统，而后采用科学的实施方法充分准备，才能促使MES正式运行、发挥效用。
要想成功实施MES，企业必须先在管理上下功夫——与MES密切相关的工作，包括车间环境、职责分工以及人员保障等方面。
1.改善车间环境
通过对生产和工作环境的分析，把生产和工作需要的物品按照工艺的需要科学地确定位置。当然还有网络的布置，上MES系统，网络是基础设施，不要等到上系统了，车间没有网络，那就尴尬了。
2.合理分工，明确职责
“计算机能够解决一切管理问题。”——这是相当一部分企业领导在实施MES时的一个误区。事实上，许多企业面临的管理问题是不可能靠计算机来解决的，必须靠企业自身通过科学的组织、严格的规章及有效的控制来解决。计算机只能通过信息的获取与加工、一定的流程控制来支持企业管理思想的贯彻。
有些企业的组织结构不合理、职能相互重叠，其结果是责任不清、相互扯皮。这一方面妨碍了MES的顺利实施，另一方面也难以保证MES正常高效地运行。因此，在实施MES时，必须对企业的业务流程进行合理重组，去除重叠的部门责能，减少无效劳动，合理分工、明确责职。这样既可以简化MES软件的权限设置和流程控制，又能够保证信息处理的及时性，为MES的实施提供组织保证。
3.提供人员保证
MES系统实施，通常涉及到计算机人员、企业管理人员、车间现场操作人员和具体业务人员等方面。不仅涉及面广，而且各类人员的文化水平、业务能力、计算机应用水平也参差不齐。因此，为了保证MES的顺利实施，必须对相关人员进行足够的培训。对不同类型、不同层次人员的培训方式应有所不同。还有涉及人员要移出时间配合培训，不然影响实施进度，和实施质量。
实际上，在整个MES实施过程中，培训工作是贯彻始终的。不仅要在实施准备阶段进行原理培训，而且在实施准备、模拟运行与试运行、切换运行、新系统运行过程中也要进行有关培训，如软硬件产品培训、系统管理员培训和持续扩大培训等。
只有企业员工对MES软硬件产品有了一定的了解，才能够保证系统最终的顺利实施和应用。
